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文章标签:SEQ  ata  CAL  调用  
nucleosome calling using ATAC-seq

  • 源代碼名稱:NucleoATAC
  • 源代碼網址:http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
  • NucleoATAC源代碼文檔
  • NucleoATAC源代碼下載
  • Git URL:
    git://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC.git
  • Git Clone代碼到本地:
    git clone http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
  • Subversion代碼到本地:
    $ svn co --depth empty http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
    Checked out revision 1.
    $ cd repo
    $ svn up trunk
  • NucleoATAC

    使用usn序列數據調用nucleosomes的python 包。 還包括用於處理對端usn數據( 或者潛在的其他配對的結束數據)的通用腳本。

    如果你在研究中使用這裡工具,請參考基因組研究的論文。

    請使用GitHub問題來產生軟體發生的任何錯誤,而不是發郵件給作者。

    在版本上注意:

    • 版本 0代表用於biorxiv手稿的代碼
    • 版本 0.2.1用於基因組研究手稿( 見補充資料)

    可以在 http://nucleoatac.readthedocs.org/en/latest/ 找到文檔。

    如果你想在NucleoATAC輸出中輕鬆讀取到 R 以便進一步處理或者探索,請查看 NucleoATACR

    目前NucleoATAC只支持 python 2.7 ( 無 python 3 ) 。 如果有人對添加 python 3支持感興趣,請點擊requests請求"



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